如果发现肛门起个肉疙瘩而且有点疼，具体的治疗方案，建议到正规的专科医院系统的检查，明确这个肉疙瘩是什么原因引起的，在及时的对症治疗。

　　如果这个肉疙瘩是由于痔疮引起的，可以采取保守治疗的方式，选择高锰酸钾稀释液局部熏洗坐浴，也可以选择温盐水熏洗坐浴，在熏洗坐浴后可以局部涂抹一些痔疮膏，或者选择栓剂肛塞治疗。

　　如果这个肉疙瘩是由于肠道肿瘤引起的，比如直肠癌，建议完善相关检查，明确肿瘤的分期。如果是早期或者中期，建议选择根治性的手术切除。如果是晚期建议选择以化疗、靶向治疗、放疗等为主的姑息性治疗。